На основании приказа НО СССР от 4 сентября 1941 года школа пилотов была переформирована в планерную школу ВДВ КА и всю войну занималась подготовкой пилотов-планеристов. Было подготовлено более 600 боевых планеристов. Семь выпускников школы, участников Великой Отечественной войны, удостоены звания Героя Советского Союза, а один из них, Талгат Бегельдинов, удостоен этого звания дважды.
Боевое Знамя училищу было вручено 25 мая 1942 года. 12 декабря 1944 года Постановлением Президиума Верховного Совета СССР училищу вручено Красное Знамя. В 1946 году училище перебазируется в Пугачёв (Саратовская обл.), преобразуется в планерное училище и занимается подготовкой командиров тяжёлых планеров.
В мае 1952-го учебная организация переименована в 160-е военное авиационное училище лётчиков и с осени 1952 года приступила к освоению принципиально новой авиационной техники - вертолета. В 1960 году оно перебазируется в Сызрань, в 1963-м получило наименование Сызранское военное авиационное училище лётчиков и в 1966 году становится высшим и теперь сызранский филиал Военно-учебного научного центра Военно-воздушных сил "Военно-воздушная академия имени профессора Н. Е. Жуковского и Ю. А. Гагарина" - одно из ведущих учебных заведений в области подготовки военных специалистов. Оно отмечает 85-летний юбилей.
За это время училище выпустило более 18 тысяч лётчиков, 51 выпускник удостоен высоких званий Героя Советского Союза, Социалистического Труда и Российской Федерации. 58 выпускников стали генералами, 169 - удостоены почётных званий "Заслуженный лётчик-испытатель" и "Заслуженный военный лётчик", около 125 выпускников окончили СВВАУЛ с золотой медалью.
17 декабря 2014 года филиалу ВУНЦ ВВС "Военно-воздушная академия" вручены Боевое (Георгиевское) Знамя и Грамота Президента Российской Федерации.
Последовательно обучение курсантов производилось на вертолетах Ми-4, Ми-1, Ми-8, Ми-2, Ми-24, Ка-27. Школа пилотов, планерная школа, планерное училище, военное авиационное училище летчиков, высшее военное авиационное училище летчиков, военный авиационный институт и снова высшее военное авиационное училище летчиков - такие ступени прошел филиал за эти годы.
- Уверен, что у вуза хорошие перспективы и большое будущее. Стране нужны настоящие авиаторы - профессионалы, нужны патриоты, окрыленные мечтой покорить небо и прославить свою Отчизну. Именно такие люди выходят из стен Сызранского высшего военного авиационного училища летчиков, - отметил губернатор Самарской области Вячеслав Федорищев, поздравляя с 85-летием.